Enfermedad infecciosa por Pseudomona aeruginosa

Ácidos Nucléicos recombinantes en la naturaleza

Recientemente se concluyó la secuencia completa del genoma de la cepa PAO1, que es la cepa tipo de P. aeruginosa y que fue aislada de un paciente con otitis media. Esta secuencia ya se encuentra disponible en el internet y su análisis fue recientemente publicado. El tamaño aproximado del único cromosoma circular que forma el genoma de esta bacteria es de cerca de 6.3 millones de pares de bases, con mucho el de mayor tamaño de los genomas de bacterias secuenciados hasta ahora. Esta cepa, al igual que muchos otros aislamientos de P. aeruginosa, no contiene plásmidos.

 ADN recombinante  artificial 

T: Pseudomona aeruginosa. Vacunas: un reto a la investigación.

O: Lograr terapias alternativas para prevenir o combatir las infecciones producidas por P. aeruginosa.

G: Genes PAO1, OprF.

ER: No especifica

EL: DNA plasmídico recombinante.

V:  pSecTag, al virus de la influenza,

CR: Células 3T3.

MTG: Transfección genética reversa

MIC: Animales inoculados, evaluados por ELISA cuantitativo.

Gilleland en 1997 utilizó específicamente el péptido 10 (residuos 305-318) de la proteína nativa OprF para desarrollar un preparado vacunal, escogiendo al virus de la Influenza A como vector para presentar este epitopo en una vacuna humanamente compatible. Varias longitudes o fragmentos del epitopo del péptido 10 fueron insertados en el gen HA (hemaglutinina) del virus de la Influenza A/WSN/33, mediante un sistema de transfección genética reversa.

BIBLIOGRAFÍA:

1.- http://www.biblioweb.tic.unam.mx/libros/microbios/Cap3/

2.- http://scielo.sld.cu/pdf/vac/v13n1/vac01104.pdf (ANEXA PARA COMPARACIÓN DE AVANCES ACTUALES Y LO QUE SE CREÍA CON EL PASO DEL TIEMPO). ACTUALIZADO.

Secuenciación o una técnica de hibridación de enfermedad renal.

 

La secuenciación Sanger es un método muy sensible para la identificación de mutaciones, pero en cada experimento sólo permite secuenciar un solo fragmento de DNA de una longitud máxima de unos 1000 nucleótidos. Por ello, para el análisis mutacional de un gen es necesario secuenciar independientemente cada uno de los exones del gen (partes que codifican para proteína del gen). La selección del primer gen candidato a secuenciar viene determinada por las características clínicas del paciente y por el porcentaje de casos que explica cada uno de los genes (p. ej. en la PQRAD el análisis secuencial generalmente se empieza secuenciando el gen PKD1 causante del 78% de los casos, el segundo gen PKD2 causante del 15%, seguido de GANAB causante del 0,3% de los casos, DNAJB11 causante del 0,1% de los casos y en aproximadamente el 7% de los casos no se encuentra mutación en ninguno de estos 4 genes).

Actualmente, la secuenciación de Sanger continúa siendo el método utilizado en determinados casos:

• Diagnóstico de una enfermedad monogénica que no presenta heterogeneidad genética y cuyo gen causante está constituido por pocos exones. Un ejemplo sería la enfermedad de Fabry causada por el gen GLA con sólo 7 exones.
• Estudio de familiares de un caso índice, cuya mutación ya ha sido identificada, para confirmar/descartar la mutación identificada en el caso índice.
• Confirmar los resultados obtenidos por técnicas de secuenciación masiva

Bibliografía:

https://www.nefrologiaaldia.org/es-articulo-enfoque-genetico-enfermedades-renales-hereditarias-359

PCR de insuficiencia renal aguda.

Tema: Polimorfismos del sistema renina-angiotensina e insuficiencia renal.

 

Objetivos: Amplificar de forma selectiva secuencias específicas de DNA para poder detectar de forma simple y rápida ciertas cantidades de DNA para comparar con ciertas enfermedades, así dar diagnósticos concretos y acertados.

Tipo de muestra: Extracción de sangre.

Tipo de ácido nucleico: DNA, desoxinucleótidos (dNTPs).

Gen o secuencia por amplificar: Genes que codifican los componentes del SRAA: polimorfismo I/D del gen de la ECA, polimorfismo M235T, y el polimorfismo A1166C del gen del receptor tipo 1 de la angiotensina II.

Tipo de PCR: Reacción en la cadena de la polimerasa.

Visualización: Electroforesis.

El proceso de desarrolla en tres pasos:

• Desnaturalización: separación de las cadenas complementarias del DNA.
• Apareamiento o «annealing»: unión de los «primers» a sus secuencias complementarias.
• Extensión: síntesis de la hebra complementaria a partir del «primer» respectivo.

La repetición de este ciclo un determinado número de veces produce un aumento exponencial de la cantidad de la región diana del DNA, hasta que se llega a un punto en que disminuye la eficiencia de la enzima, y la reacción deja de ser exponencial.

 

Bibliografía :

1. https://www.revistanefrologia.com/es-genes-enfermedad-renal-i-generalidades--articulo-X0211699502027438
2. https://academic.oup.com/ndt/article/35/Supplement_3/gfaa142.P1737/5851991?login=true

Alteraciones de la Epigenómica de insuficiencia renal

 

Hablando de SALUD RENAL, podemos decir en términos generales que al ser los riñones órganos ENDOTELIALES, se convierten en el “albo” de los procesos inflamatorios y de “autoinmunidad patológica “ como respuesta a un sinfín de agresiones que se expresan clínicamente como la Hipertensión Arterial y/o como una pérdida paulatina de las funciones cuyo anuncio precoz es la aparición de proteína en la orina (de hecho es el examen de orina simple en donde podemos corroborar más del 90% de los diagnósticos de enfermedades renales).

Con la aparición de la EPIGENETICA ahora tenemos conocimiento del mecanismo de activación o desactivación de la vía de la Angiotensina hasta provocar la expresión o no, del gen de la NEFRINA, que puede ser modulado por la acción de fármacos inhibidores de la Angiotensina y así también podemos hablar de otro viejo fármaco , como es la Hidralazina, que también genera un beneficio en el control de la proteinuria al incidir sobre los mecanismos de metilación del ADN o Acetilación de las Histonas; provocando la inhibición o silenciamiento génico como efecto beneficio en el control de la enfermedad renal.

Bibliografía:

1. https://www.revistanefrologia.com/es-introduccion-epigenetica-nuevo-paradigma-nefrologia-articulo-X1888970017612260
2. https://digibuo.uniovi.es/dspace/bitstream/handle/10651/58275/TD_PaulaDiazBulnes.pdf?sequence=1

Alteración de la Traducción en la insuficiencia renal.

 

El código genético es un conjunto de normas por las que la información codificada en el material genético (secuencias de ácido desoxirribonucleico -ADN - o ácido ribonucleico -ARN) se traduce en proteínas en las células vivas. Las proteínas son macromoléculas que consisten de cadenas lineales formadas por bloques fundamentales llamados aminoácidos. Asombrosamente solo hay 20 tipos diferentes de aminoácidos, los cuales, dependiendo del número y del orden en el cual se conecten entre sí, permitirán crear una gran variedad de proteínas, cada una de ellas con una función específica. Por lo que podríamos decir que los aminoácidos son los “ladrillos” (estructuras fundamentales) de las proteínas.

La secuencia de DNA del genoma humano está contenida en 23 pares de cromosomas en el núcleo de cada célula diploide y contiene la información genética necesaria para el desarrollo y funcionamiento de un ser humano. El genoma humano está formado por 3 billones de pares de bases o nucleótidos [Adenina (A), Citosina (C), Timina (T), Guanina (G)] que contienen unos 20.000 genes. La parte codificante de los genes se denominan exones y al conjunto de todos los exones (~180.000) de todos los genes del genoma se le denomina exoma.

Factores posiblemente alterados:

Mosaicismo.

Inactivación de cromosoma X.

Regulación epigenética.

Mutaciones splicing.

Bibliografía:

Ars E. Enfoque Genético de las Enfermedades Renales Hereditarias | Nefrología al día [Internet]. Nefrologiaaldia.org. 2021 [cited 27 June 2021]. Available from: https://www.nefrologiaaldia.org/es-articulo-enfoque-genetico-enfermedades-renales-hereditarias-359

Hidalgo U. Las proteínas y el código genético [Internet]. Uaeh.edu.mx. 2021 [cited 27 June 2021]. Available from: https://www.uaeh.edu.mx/scige/boletin/icbi/n1/e7.html

Alteraciones de la Transcripción en la Insuficiencia Renal

 

El  sistema  renina-angiotensina-aldosterona  (SRAA)  no  sólo  está  implicado  en  diversas enfermedades  cardiovasculares  sino  que  tiene  un  papel  determinante  en  la fisiopatología renal  y  en  la  progresión  de  las  enfermedades  renales.  Se han identificado diversos polimorfismos de genes que codifican los componentes del SRAA, entre los que destacan el polimorfismo I/D del gen de la ECA, una variante del gen del angiotensinógeno, el polimorfismo M235T, y el polimorfismo A1166C del gen del receptor tipo 1 de la angiotensina II.  Diversos estudios sugieren la importancia del polimorfismo I/D del gen de la ECA en la progresión de las enfermedades renales y probablemente en la mortalidad cardiovascular de los pacientes con insuficiencia renal.  Por el contrario, la importancia de los polimorfismos del SRAA como determinantes de la prevalencia de las enfermedades renales y de la respuesta al tratamiento reno protector es contradictoria. Debido a la naturaleza poligénica de  las  enfermedades  renales  y  cardiovascular-lares  y  el  número  creciente  de  genes  potencialmente  implicados,  son  necesarios estudios prospectivos colaborativos que incluyan amplio número de pacientes para evaluar  el  efecto  de  los  polimorfismos  del  SRAA sobre  la  progresión  de  la  enfermedad  renal  y  la  respuesta  al  tratamiento  renoprotector.

Bibliografía:

1. Morgado J. Epigenética en la enfermedad renal: Investigación de las proteínas BET como potenciales dianas terapéuticas. [Internet]. Repositorio.uam.es. 2018 [cited 20 June 2021]. Available from: https://repositorio.uam.es/bitstream/handle/10486/682711/morgado_pascual_jose_luis.pdf?sequence=1
2. https://scielo.isciii.es/pdf/enefro/v20n4/2255-3517-enefro-20-04-367.pdf

Alteraciones genéticas en las enfermedades renales:

 Insuficiencia Renal Aguda

 

Las enfermedades renales en la genética tienen varios patrones clínicos, estos patrones pueden ser: glomerular, quístico, tubulopatías, intersticiales o síndromes.

Hay dos tipos de ERP: la ERP autosómica dominante y la ERP autosómica recesiva. La ERP autosómica dominante causa quistes solo en los riñones. Es a menudo conocida como "ERP del adulto", porque las personas con este tipo de ERP pueden no notar ningún síntoma hasta que tengan entre 30 y 50 años de edad. La ERP autosómica recesiva hace que los quistes crezcan en los riñones y en el hígado. La ERP autosómica recesiva es a menudo llamada ERP infantil porque los bebés pueden mostrar signos de la enfermedad en sus primeros meses de vida, o incluso antes de nacer.

ERPAD: Casi siempre se hereda de un padre que también tiene ERPAD. Para heredar la enfermedad, un niño necesita tener solo un padre con ERPAD. Un niño que tiene un padre con ERPAD tiene una probabilidad de 50/50 de heredar la enfermedad. Si ambos padres tienen ERPAD, su hijo nacerá con la enfermedad.

La insuficiencia renal aguda está presente en las de enfermedades renales de patrón intersticial, estas enfermedades son genéticas, por lo tanto, está causada por un problema con los genes de la persona que la padece.

 

1. Kidney A. Enfermedades de los riñones [Internet]. American Kidney Fund. 2021 [citado 13 junio 2021]. Disponible en: https://www.kidneyfund.org/en-espanol/enfermedad-de-los-rinones/tipos/
2. Kidney A. Enfermedad renal poliquística (PKD) [Internet]. American Kidney Fund. 2021 [citado 13 junio 2021]. Disponible en: https://www.kidneyfund.org/en-espanol/enfermedad-de-los-rinones/tipos/enfermedad-renal-poliquistica-pkd.html
3. Martínez Jiménez V, Torra R. Enfoque Clínico de las Enfermedades Renales Hereditarias [Internet]. Nefrología al día. 2019 [citado 13 junio 2021]. Disponible en: https://www.nefrologiaaldia.org/es-articulo-enfoque-clinico-enfermedades-renales-hereditarias-254